Gracias a la riqueza de sus tierras, Guanacaste cuenta con gran variedad de parques y áreas protectoras, algunas de las cuales mencionaremos a continuación:
· Parque Nacional Santa Rosa: El sector de Santa Rosa cuenta con la muestra más importante de bosque tropical seco en Centroamérica. En este bosque habitan especies como el venado cola blanca, monos congo y carablanca, etc. También posee dos playas: Naranjo y Nancite. En la primera se puede acampar y en la segunda que se maneja como una estación biológica, desovan las tortugas Loras. Finalmente, Santa Rosa tiene gran relevancia histórica por cuanto allí aconteció la Batalla de Santa Rosa. Cerca del área administrativa hay estacionamiento, mesas para almuerzos campestres, baños, agua potable y área para acampar. Asimismo, se cuenta con miradores y senderos. En este sector hay además diversos senderos y miradores, así como otros lugares de interés: Monumento a los héroes de 1856 y 1955, y la casona histórica, que fue totalmente reconstruida en el 2002.
· Parque Nacional Rincón De La Vieja: Este Parque Nacional comprende al macizo donde se ubica el Volcán Rincón de la Vieja. Tiene una extensión de 14.083 hectáreas. Cuenta con nueve conos y una laguna: La jilgueros. Sector Pailas: sendero a los cráteres Von Seebach y Rincón de la Vieja, sendero a las pailas, sendero a las cataratas La Cangreja y Escondidas, sendero a la poza Río Blanco, sendero a las fumarolas y volcancitos de barro.
· Parque Nacional Marino Las Baulas Y Refugio Nacional De Vida Silvestre Tamarindo: Ambas áreas silvestres se ubican principalmente en el sector de playa Grande y en el estero de Tamarindo. El principal atractivo turístico del Parque es el desove de la tortuga Baula, radica en el anidamiento de la tortuga marina más grande del mundo, un animal en peligro de extinción que se protege en Costa Rica. En el Refugio, el principal atractivo es el manglar que cuenta con árboles con excelente desarrollo. Las especies de mangle más comunes son: rojo, negro, blanco y piñuela. Estos bosques de mangle son el lugar óptimo para la reproducción de peces, crustáceos y moluscos. También se pueden observar reptiles, anfibios y aves. Hay tours para observar la anidación de las tortugas Baulas y para recorrer el estero de Tamarindo.
· Parque Nacional Palo Verde: Este Parque Nacional se ubica a 15 km al sur de la ciudad de Bagaces. Palo Verde ocupa una zona compuesta por llanuras inundables, así como lagunas y pantanos salobres y de agua dulce. Este es uno de los hábitats donde se halla la mayor concentración de aves acuáticas de Costa Rica. Casi 300 especies de aves son las que se han identificado en este Parque Nacional y por ello se estima que esta área silvestre es uno de los lugares en Centroamérica más importantes para la observación de aves. Otros atractivos de este Parque son los mamíferos que se pueden apreciar. También cuenta con 36 kilómetros navegables en el río Tempisque. Cuenta con agua potable, letrinas, albergue para investigadores, senderos y miradores.
